針對立法院朝野協商決議禁止美牛內臟、絞肉進口，美國政府強烈反應一事，台灣團結聯盟主席黃昆輝表示，美國政府應該理解台灣是一個民主國家，依照任何國際協議，國會未通過，協議就無法生效，這是國際民主國家的基本運作原則，美方應有此理解。美牛的問題出在於馬政府剛愎自用、傲慢，不和民間溝通所造成的，這不是台美關係的危機，是馬政府的執政信心危機。

    黃昆輝表示，美牛進口事件如果馬政府在事前好好和國會及民間溝通，尤其是利益關係團體說明，在和美國談判前就了解民間需求，對美談判堅持台灣人民利益，台灣人民怎麼會不支持政府的決議呢？但是，江陳會四項協議如此、ECFA非簽不可，也是如此，馬政府一向高傲自許，無視民意，不溝通、不說明，一意孤行，才會導致如此大風波。

    黃昆輝說，有人說這是台美關係的危機，其實不是，美國是民主國家，應該可以了解台灣做為一個民主國家，國會有反對政府政策的最終權力，美國和其他國家有很多協議，也是因為國會不能通過而無法生效。台聯已經針對此向監察院提出糾正舉發，馬政府和美國的議定書，根據憲法精神就是「國際書面協定」，必須要立院通過才能生效。這點，他說，我國立法院是完完全全站得住腳，他呼籲立法院一定要維持台灣人民的尊嚴，堅持以台灣人民的利益為主，不要退縮立場，否則會在國際上形成美國壓迫台灣國會的錯誤形象，對美國、對台灣都是負面形象，一方面破壞台灣民主形象，一方面陷美國於不義，造成美國壓迫台灣國會的形象。

    所以，黃昆輝強調，如果說美牛事件是危機的話，也絕非一般的國際外交上國家對國家的危機，美國人的反彈對象是一個無能處理國內問題、又太輕易妥協、答應太多的馬政府，絕不是台灣人民。

    針對美國聲明中所說，「美國已採取符合科學依據並與世界動物衛生組織準則一致的全面作法、規範與慣例」，台聯指出，根據世界動物衛生組織OIE規範，任何有疾病風險的動物及其相關產品進口，進口國都應進行「進口風險分析」，其內容必須包括四大項：損害認定、風險評估、風險管理以及風險溝通，這四項，馬政府都完全沒有遵照世界動物衛生組織OIE的規定進行。

    黃昆輝指出，OIE所關健康標準(Health Standards)中，對陸生動物健康規範(Tererstrial Animal Health Code)第二章Chapter 2.1有關進口風險分析中，寫的非常明白，損害認定、風險評估、風險管理，以及風險溝通都有詳細規範，這些馬政府都沒有進行，舉風險溝通為例，必須將從可能之受害者或利益團體(如消基會、畜牧業等)收集損害及風險的相關資訊及意見，並且必須在每一個決策過程中都和相關利益關係團體及國會進行溝通。馬政府根本就對此一無所知，更不用說有任何依循世界動物衛生組織規範的動作了，黃昆輝要求馬政府相關官員應該好好去了解一下相關國際規範，才能處理妥當國際事務。